但是,傳說若能將從古代傳承下來的龍寶玉和光之巫女的力量結合,那麼ヒルコ的人們也能沐浴到光芒.有一個人相信這一傳說,逃離了ヒルコ.
故事就是從這里開始的.
同時,一伙被稱為鬼門眾的忍者開始盯上了被盜走的寶玉和隱居的光之巫女.這伙人是在替企圖再興豐臣家的暗公方活動.他們的目的是什麼呢?在深深的謎團中,ヒルコ與鬼門眾為了寶玉展開了激烈的爭斗.
在這場爭斗中,有個人因為意想不到的原因被卷了進來.他的名字叫牙神獸兵衛.持有絕技疾風之居合——鐮鼬,他是個相當厲害的"雇傭忍者".
雖然獸兵衛說他只是因為睡覺被吵醒了才發怒的,以後不會再參與這場爭斗,但是命運卻一步步地將他與寶玉和巫女聯系在一起.不只是偶然還是受誰的指引,獸兵衛來到了巫女的隱居地,見到了美麗的少女巫女——時雨.這里受到鬼門眾的襲擊,已經被毀滅了.
獸兵衛和老忍者濁庵和少年忍者飛礫一起,踏上了保護被追殺的時雨的旅程.時雨從濁庵那里得知自己似乎與柳生一族有某種關系,為了探求自己出生的秘密,開始前往柳生之村.
前進的途中接連不斷有ヒルコ忍群和鬼門眾的忍者來襲,他們使出種種妖術,但是在獸兵衛的疾風之太刀前無一不被斬殺得粉碎.
引發激烈爭斗的寶玉與光之巫女,它們真正的力量又是什麼呢...?!
